Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap3m1Q9JKC8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms