Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tuba8Q9JJZ2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tuba8Q9JJZ2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms