Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trim39Q9ESN2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trim39Q9ESN2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Trim39Q9ESN2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Trim39Q9ESN2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim39Q9ESN2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim39Q9ESN2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim39Q9ESN2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim39Q9ESN2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim39Q9ESN2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trim39Q9ESN2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trim39Q9ESN2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim39Q9ESN2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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