Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtofQ9ESF1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms