Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms