Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spock2Q9ER58 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms