Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms