Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr9Q9EQU3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr9Q9EQU3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr9Q9EQU3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr9Q9EQU3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr9Q9EQU3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms