Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpbpQ9EQI5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpbpQ9EQI5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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