Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf8Q9EQH4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf8Q9EQH4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms