Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpgrip1Q9EPQ2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms