Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms