Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U2

Tmem41a, Transmembrane protein 41A, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem41aQ9D8U2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem41aQ9D8U2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem41aQ9D8U2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem41aQ9D8U2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem41aQ9D8U2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem41aQ9D8U2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem41aQ9D8U2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem41aQ9D8U2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem41aQ9D8U2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms