Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4cQ9D7F7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4cQ9D7F7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4cQ9D7F7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4cQ9D7F7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4cQ9D7F7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4cQ9D7F7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4cQ9D7F7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4cQ9D7F7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp4cQ9D7F7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms