Protein–RNA interactions for Protein: Q9D735

Trir, Telomerase RNA component interacting RNase, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrirQ9D735 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrirQ9D735 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrirQ9D735 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms