Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb4aQ9D6F9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4aQ9D6F9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms