Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23bQ9D662 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23bQ9D662 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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