Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms