Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms