Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhc2Q9D485 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhc2Q9D485 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhc2Q9D485 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhc2Q9D485 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhc2Q9D485 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhc2Q9D485 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhc2Q9D485 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhc2Q9D485 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhc2Q9D485 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhc2Q9D485 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhc2Q9D485 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Efhc2Q9D485 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Efhc2Q9D485 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Efhc2Q9D485 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhc2Q9D485 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms