Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lamp5Q9D387 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp5Q9D387 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms