Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tmed11Q9D2R4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tmed11Q9D2R4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Tmed11Q9D2R4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Tmed11Q9D2R4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed11Q9D2R4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Tmed11Q9D2R4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Tmed11Q9D2R4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tmed11Q9D2R4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tmed11Q9D2R4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tmed11Q9D2R4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tmed11Q9D2R4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tmed11Q9D2R4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms