Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1N2

Gpihbp1, Glycosylphosphatidylinositol-anchored high density lipoprotein-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpihbp1Q9D1N2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gpihbp1Q9D1N2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpihbp1Q9D1N2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms