Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acsl3Q9CZW4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acsl3Q9CZW4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141 ms