Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms