Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thumpd2Q9CZB3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms