Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nde1Q9CZA6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms