Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms