Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Bud23Q9CY21 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Bud23Q9CY21 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Bud23Q9CY21 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Bud23Q9CY21 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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