Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Msmo1Q9CRA4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Msmo1Q9CRA4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msmo1Q9CRA4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms