Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd1Q9CR42 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd1Q9CR42 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms