Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn2Q9CQS6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms