Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2Q9CQP2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms