Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms