Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms