Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms