Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd1Q9CQA6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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