Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc5Q9CQA1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms