Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ncbp2Q9CQ49 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms