Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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