Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Pcgf6Q99NA9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms