Protein–RNA interactions for Protein: Q99N57

Raf1, RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raf1Q99N57 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raf1Q99N57 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms