Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PccbQ99MN9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PccbQ99MN9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PccbQ99MN9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PccbQ99MN9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PccbQ99MN9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PccbQ99MN9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PccbQ99MN9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PccbQ99MN9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PccbQ99MN9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PccbQ99MN9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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PccbQ99MN9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PccbQ99MN9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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