Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nmd3Q99L48 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms