Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms