Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms