Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spef1Q99JL1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spef1Q99JL1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms