Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms