Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Slc8b1Q925Q3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Slc8b1Q925Q3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Slc8b1Q925Q3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Slc8b1Q925Q3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Slc8b1Q925Q3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Slc8b1Q925Q3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Slc8b1Q925Q3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Slc8b1Q925Q3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Slc8b1Q925Q3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Slc8b1Q925Q3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc8b1Q925Q3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Slc8b1Q925Q3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Slc8b1Q925Q3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Slc8b1Q925Q3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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