Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms